水产加工业克服诸多困难，通过大力发展精深加工，积极实施内外贸并举战略，实现了平稳发展，全年实现总产值162亿元，比上年增长7.9%，精深加工比例达到41.5%。

    水产品出口遇到国际贸易摩擦和国内外贸宏观政策调整的影响，基本保持上年水平，全年出口水产品7.32亿美元。

水产品精深加工企业的培育与认定工作进一步推进，新认定企业44家。积极推广水产企业GMP认证工作，有4家企业通过CMP达标考核；积极做好先进技术的推广与应用，组织召开了水产品精深加工技术成果交流会和船舶科技创新论坛。

    2008年目标:水产品加工业产值达到175亿元，水产品精深加工比例提高2个百分比。

    近年来，由于受渔业资源衰退、人民币升值、出口退税政策调整、出口贸易壁垒影响等，水产品加工业面临前所未有的严峻形势，已到了必须加快产业结构调整，推进全行业整合提升的关键阶段。要积极改变经济增长方式，着力推进水产品加工业向“精深化、规模化、多元化、国际化”升级。进一步引导水产加工业发展精深加工。通过政策扶持和精深加工企业龙头认定等措施，引导企业走品牌发展和科技创新之路，鼓励企业开发生产市场前景好的海洋医药、保健品等海洋生物产品。推动企业不断提高水产品加工的深度。加快开拓内贸市场，促进内外贸并举发展。根据当前国内市场逐步看好而国际市场贸易壁垒增多的现实，引导企业创新销售模式，加大拓展国内市场力度，改变水产加工业单纯依赖外贸的营销模式，实现内外贸并举发展。鼓励龙头企业采用兼并、收购、重组、合作等扩张形式走强强联合、虚拟联合、强弱联合之路。加大对水产品精深加工龙头企业培育力度，重点扶持其扩大规模，提升产业竞争力。培育和扶持一批特色加工企业，并依靠龙头企业带动，努力把舟山建设成具有较强行业竞争力的国内著名水产品精深加工基地。